#ifndef _EASYGENE_H_
#define _EASYGENE_H_

#include "etcache.h"

typedef struct t_exon {
  off_t   start;
  off_t   end;
} EXON;

typedef struct t_easygene {
  char      target[NAME_MAX_LEN + 1];
  off_t     start;
  off_t     end;
  char      name[NAME_MAX_LEN + 1];
  char      url[URL_MAX_LEN + 1];
  char      strand;
  int       exonnum;
  EXON      *exons;
  int       optnum;
  OPTATTR   *optattrs;
} EasyGene;

typedef struct t_easygenetrack {
  ET_TYPE   ettype;
  char      name[NAME_MAX_LEN + 1];
  char      comment[COMMENT_MAX_LEN + 1];
  char      desc_url[URL_MAX_LEN + 1];
  COLOR     color;
  char      species[NAME_MAX_LEN + 1];
  char      revision[NAME_MAX_LEN + 1];
  char      species_url[URL_MAX_LEN + 1];
  int       genenum;
  EasyGene  *genes;
  char      date[DATE_LEN + 1];
  char      opt_attr[ATTR_VALUE_MAX_LEN + 1];
} EasyGeneTrack;

/* 指定条件を満たす遺伝子情報を含むEasyGeneTrack/EasyGraphTrackを出力する。 */
/* 戻り値  1: 成功(EasyGeneTrackを出力)                                     */
/*         2: 成功(EasyGraphTrackを出力)                                    */
/*         0: 失敗                                                          */
/* 副作用  指定されたストリームにEasyGeneTrack/EasyGraphTrackを書き出す     */
// DB スキーマ変更対応
int getEasyGeneOrGraphTrack(char *, /* trackname: 表示すべきEasyTrackの名前 */
                            char *, /* species:   表示すべき種              */
                            char *, /* revision:  表示すべき種のリビジョン  */
                            char *, /* target:    表示すべき対象            */
                            int,    /* start:     表示開始位置(0-origin)    */
                            int,    /* end:       表示終了位置(0-origin)    */
                            int,    /* width:     出力すべき画像幅の指標    */
                            char *, /* date:      EasyTrackの作成日付       */
                            char *, /* stream: 出力先ストリーム(ファイル)名 */
                            int,    /* threshold: EasyGraphTrackへの閾値 */
                            int,    /* 追加属性のSelect型で検索する */
                            char *, /* : 追加属性のSelect型の名前   */
                            char *, /* : 追加属性のSelect型の値     */
                            int,    /* :   追加属性のReal型で検索する  */
                            char *, /* : 追加属性のReal型の名前        */
                            double,    /* optRealLower: 追加属性のReal型で下限値      */
                            double     /* optRealUpper: 追加属性のReal型の上限値      */
);

#endif