INSTALL = install
MVN = mvn
INSTALL_DIR = /usr/local
UTGB_DIR = $(INSTALL_DIR)/utgb

BINARY = target/utgb-shell-bin.jar
SCRIPT_DIR = src/main/script

JAVA=$(shell find src/main/java -name '*.java')

.phony: all install clean package 


all: package

package: $(BINARY)


$(BINARY): $(JAVA)
	$(MVN) package

install: $(BINARY) $(SCRIPT_DIR)/utgb
	mkdir -p $(INSTALL_DIR)/bin
	mkdir -p $(UTGB_DIR)
	mkdir -p $(UTGB_DIR)/lib
	mkdir -p $(UTGB_DIR)/bin
	$(INSTALL) -m 755 $(BINARY) $(UTGB_DIR)/lib
	$(INSTALL) $(SCRIPT_DIR)/utgb $(UTGB_DIR)/bin
	$(INSTALL) $(SCRIPT_DIR)/utgb.bat $(UTGB_DIR)/bin
	$(INSTALL) src/main/java/org/utgenome/shell/utgb-icon-mac.png $(UTGB_DIR)/
	ln -sf $(UTGB_DIR)/bin/utgb $(INSTALL_DIR)/bin/utgb

uninstall: 
	rm -rf $(UTGB_DIR)
	rm -f $(INSTALL_DIR)/bin/utgb

dist:	

clean:
	mvn clean